Se compone de Lugares de Importancia Comunitaria (LIC), que son declarados como Zonas Especiales de Conservación (ZEC) una vez se aprueban los planes de gestión. La Red Natura 2000 también incluye Zonas de Especial Protección para las Aves (ZEPA).

Estas figuras de protección buscan asegurar a largo plazo los valores naturales que albergan estos espacios y garantizar la sostenibilidad de las actividades que se desarrollan en ellos.

Gracias a la declaración de otras figuras de protección, España ha alcanzado el 21 % de la superficie marina protegida.

El proyecto LIFE INTEMARES proporciona un escenario único para promover y explorar las oportunidades que ofrecen los espacios marinos de la Red Natura 2000 para constituirse en áreas de referencia en un modelo asentado en la investigación y comprometido con la conservación de los valores y recursos marinos.